Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Traf3Q60803 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms