Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms