Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms