Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11487Q5RIS0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm11487Q5RIS0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11487Q5RIS0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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