Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms