Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms