Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms