Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms