Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms