Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Skap2Q3UND0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms