Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms