Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc34Q3UI66 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc34Q3UI66 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms