Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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