Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Arfgef3Q3UGY8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Arfgef3Q3UGY8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms