Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms