Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ccndbp1Q3TVC7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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