Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Fndc4Q3TR08 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Fndc4Q3TR08 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Fndc4Q3TR08 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Fndc4Q3TR08 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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