Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ctdnep1Q3TP92 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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