Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms