Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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