Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms