Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms