Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms