Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms