Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms