Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms