Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms