Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AmbpQ07456 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms