Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms