Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms