Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms