Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp39Q02525 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms