Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms