Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RykQ01887 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms