Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VcpQ01853 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VcpQ01853 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 503.3 ms