Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms