Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms