Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms