Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlbpP97440 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SlbpP97440 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms