Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

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Length 988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nbr1P97432 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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