Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptlc2P97363 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptlc2P97363 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms