Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SmsP97355 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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SmsP97355 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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SmsP97355 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SmsP97355 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SmsP97355 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SmsP97355 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms