Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pkp1P97350 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pkp1P97350 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms