Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms