Protein–RNA interactions for Protein: P84444

Ccl21a, C-C motif chemokine 21a, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21aP84444 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl21aP84444 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21aP84444 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms