Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad50P70388 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms