Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms