Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms