Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Acta1P68134 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Acta1P68134 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Acta1P68134 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms