Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Lmo4P61969 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Lmo4P61969 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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